Музыкой начала заниматься в возрасте пяти лет, с восьми лет выступала с сольными концертами в сопровождении камерного оркестра Мариинского театра и в дуэте с отцом – флейтистом В. Федотовым.

В 1996 году окончила Санкт-Петербургскую государственную консерваторию имени Н.А. Римского-Корсакова, где училась у профессора А. Вавилиной – солистки легендарного оркестра Мравинского.

В 1991 году стала солисткой Большого симфонического оркестра имени П.И. Чайковского под управлением В. Федосеева, успешно сочетая оркестровую работу с насыщенной сольной карьерой.

Мария Федотова – участница международных фестивалей в Базеле ("Les Muséiques"), Санкт-Морице ("Snow and Symphony"), Париже ("Bach et la transcription"), Брюсселе ("Europalya"), Зальцбурге, Вербье, Брегенце, Гштаде, Эльмау и других европейских городах. С сольными программами выступала в зале Музикферайн (Вена), «Городе музыки» и Театре Елисейских полей (Париж), Музикхалле (Гамбург). В России ее сольные и ансамблевые концерты проходили на фестивалях «Декабрьские вечера Святослава Рихтера», «Дворцы Санкт-Петербурга», "Crescendo", на Московском Пасхальном фестивале, в Большом зале Московской государственной консерватории имени П.И. Чайковского и Санкт-Петербургской академической филармонии имени Д.Д. Шостаковича, Государственной академической капелле Санкт-Петербурга.

Как приглашенная солистка играла в составе Всемирного оркестра мира под управлением В. Гергиева и Венского филармонического оркестра под управлением З. Меты. В разное время сотрудничала с целым рядом выдающихся дирижеров, среди которых В. Федосеев, Ю. Темирканов, Т. Курентзис, В. Юровский, Ю. Франтц, А. Титов, Р. Кофман, А. Кац, С. Сондецкис, А. Шахмаметьев, Й .Вильднер, А. Болтон. В ансамблевых программах выступала вместе с Г. Кремером, Т. Гринденко, Ю. Башметом, А. Рудиным, А. Князевым, М. Бургом, Д. Илларионовым, Н. Йосино, М. Петри.

Репертуар Марии Федотовой охватывает четыре столетия музыки от эпохи барокко до современных сочинений. В ее исполнении в России впервые прозвучали флейтовые сочинения К. Роуза, Н. Рорема, Л. Бернстайна, Т. Такемицу, Б. Тищенко, В. Мартынова, Г. Канчели, Э. Картера, Р. Фрайзитцера, Т. Хайниша, Т. Майера, В. Янарчековой, П. Карманова, К. Зграи, А. Мальциса, И. Вдовина и других современных композиторов. Помимо современной флейты Мария Федотова владеет исторически ориентированным исполнением и сотрудничала с ансамблями старинной музыки "Ars Consoni" и «Академия старинной музыки». Записи Марии Федотовой выпущены на компакт-дисках.

Оказывает поддержку молодым талантливым музыкантам и проводит мастер-классы в России (в рамках проектов «Река талантов» и «Сириус») и за рубежом – в Армении, Литве, Португалии, Японии. В настоящее время преподает в Санкт-Петербургской консерватории.

С 2012 года – солистка Симфонического оркестра Мариинского театра.

В составе оркестра исполняет сольные партии в оперных и балетных спектаклях, с сольными и ансамблевыми программами выступает в камерных залах театра. 

май 2025