Эрнст Валли родился в Вене в 1976 году. Обучался по классу органа и фортепиано у Франца Фальтера и Джеймса МакЧесни, затем поступил в Венскую консерваторию, где учился как органист под руководством Майкла Радулеску. Там же изучал композицию, его учителями были Дитер Шерманн и Майкл Джаррелл. Брал уроки композиции у Фредерика Дурье в Парижской высшей национальной консерватории музыки и танца.

На протяжении многих лет выполнял обязанности литургического органиста. Затем он стал работать «музыкальным ассистентом» в соборе Святого Стефана в Вене (до 2010 года), после чего занял там должность постоянного органиста (органиста собора).

Также музыкант играл с Симфоническим оркестром Венского радио, с Венским симфоническим оркестром, с Тонкюнстлероркестром и был занят в выступлениях Венского общества любителей музыки.

Эрнст Валли дал большое количество концертов за рубежом, в Европе и России. Пишет органную камерную и духовную музыку, также сочинял на заказ специально для международного фестиваля «Каринтийское лето» и серии органных концертов в Вене. Работы музыканта были представлены в самых разных странах Европы.