Дмитрий Ушаков родился в Москве. В 1998 году с отличием закончил Академическое музыкальное училище при Московской государственной консерватории (класс органа Г.В.Семёновой). Окончил Московскую государственную консерваторию им.П.И.Чайковского как музыковед (класс Ю.Н.Холопова и В.С.Ценовой) и органист (класс О.Г.Янченко). После окончания консерватории в 2004 году продолжил совершенствоваться в игре на органе в Казанской консерватории (класс Р.К.Абдуллина). В 2007 году окончил Казанскую консервтаорию и аспирантуру Московской консерватории. Принимал участие в мастер-классах М.Шапюи, Х.Фогеля, Т.Копмана, М.Радулеску, М.Зандера, Л. ван Дусселаара, Б. ван Остена, У.Бёме, Х.Геринга, Б.Брюндорф, Ш.Энгельса, В.Баумгратца, Г.Гнанна, Ю.Эссля и в стажировке Летней Академии в Хаарлеме (Нидерланды, 2010).

Ведет активную концертную деятельность. Его записи звучат в эфире радиостанций классической музыки Австрии, Белоруссии, Бельгии, Латвии и Швеции.

В 2012 году преподавал в РАМ им.Гнесиных на кафедре органа. Автор научных статей по истории, теории музыки и органного искусства.

С 1999 по 2012 год — органист храма св. Людовика Французского в Москве. С 2011 – музыкальный директор и органист в Евангелическо-лютеранском кафедральном соборе св. Петра и Павла. С 2012 года – штатный органист и художественный руководитель Томской областной государственной филармонии. С 2018 года органист и художественный руководитель хора в храме Покрова пресв. Богородицы в Томске. С 2017 года проводит цикл органных концертов в Томском государственном университете.

Лауреат всероссийского и международного конкурса. Организатор фестивалей органной музыки (среди них – "Rheinberger-Fest" при поддержке княжества Лихтенштейн). Участник всероссийских и международных фестивалей, среди которых «От Рождества до Рождества», «Музыка в изгнании», "Livadia-Fest".

С 2002 по 2013 год работал ведущим радио классической музыки «Орфей» (проекты «Еврорадио представляет…», «Евромикс», «И.С. Бах и его кантаты», «Моцарт сегодня», «Открытый урок»).