Родился в Милане в 1983 году. Даниэле Рустиони окончил Консерваторию имени Джузеппе Верди (Милан) по специализации орган, сочинение музыкальных произведений для органа, фортепиано, дирижерское искусство.
Получил дополнительное образование по дирижерскому искусству в Высшей музыкальной академии Пескары, Музыкальной академии Киджана Сиены и в Королевской музыкальной академии Лондона. Участвовал в мастер-классе Сэра Колина Дэвиса и Джанандреа Нозеда. Является главным приглашенным дирижером английского фестиваля «Ashovert Music Festival», заместителем декана вокального факультета Королевской музыкальной академии и преподавателем певческого искусства в Национальной студии оперы, где работает также в качестве ассистента Сэра Колина Дэвиса.
Работал в качестве пианиста-аккомпаниатора при хоре Симфонического оркестра «Дж. Верди» и вел классы пения в Академии искусств и ремесел спектакля при театре Ла Скала. Сотрудничает с хором театра Ла Скала, который сопровождает во время гастролей по Италии и за рубежом. Являлся дирижером Регионального оркестра Тосканы во Флоренции, Академического оркестра во время фестиваля «Музыкальные недели в Стрезе» (2006) и Симфонического оркестра Пескары в Италии; за рубежом – Симфонического оркестра Вупперталя в Германии, Симфонического оркестра Нордфьордской Оперы в Норвегии, «BIT20 Ensemble», Симфонического оркестра Института Бард в Нью-Йорке, Симфонического оркестра Королевской музыкальной академии и Симфонического оркестра Кингс- колледжа в Лондоне.
В июне 2007 дебютировал с оркестром Театро Реджо города Турин во время концерта, посвященного сочинениям Моцарта. В июле 2008 Даниэле Рустиони будет дирижировать оперой «Богема» Пуччини театра Реджо в рамках летнего фестиваля в замке Раккониджи. 25 и 26 января 2008 года состоялся дебют молодого талантливого итальянского маэстро в Михайловском театре (Санкт-Петербург).