Марек Яновский родился в Варшаве, вырос и учился в Германии. С конца 1970-х годов регулярно приглашался к сотрудничеству ведущими театрами мира – Метрополитен-опера, Баварской государственной оперой, оперными театрами Берлина, Гамбурга, Вены, Парижа, Сан-Франциско, Чикаго. В 1990-х годах полностью посвятил себя концертной деятельности. Возглавлял филармонический оркестр Радио Франс (1984–2000), кельнский Гюрцених-оркестр (1986–1990) и филармонический оркестр Монте-Карло (2000–2005), работал с Дрезденским филармоническим оркестром. C 2002 года занимает пост художественного руководителя симфонического оркестра Берлинского радио, в 2005 году принял на себя также художественное руководство Оркестром Романской Швейцарии. Выступает с цюрихским Тонхалле-оркестром и симфоническим оркестром Датского радио, Оркестром де Пари и Филадельфийским оркестром, симфоническими оркестрами Питтсбурга, Бостона, Сан-Франциско. Имеет обширную дискографию – более 50 записей, многие из которых удостоены премий.